Taxonomie is een wetenschappelijke richting binnen de biologie die zich onder andere bezighoudt met het benoemen van organismen. De zweedse bioloog Linnaeus die leefde van 1707-1778 en in Nederland promoveerde wordt over het algemeen beschouwd als de grondlegger ervan. Hij introduceerde de binomiale nomenclatuur (het beschrijven van een organisme met een geslachtsnaam en een soortduiding). Zijn bekendste werk de 'Systema Naturae', uitgegeven in 1735 in Leiden, geldt als startpunt van de naamgeving van de dieren (zoologische nomenclatuur). Honingbijen zijn binnen de huidige taxonomische systematiek als volgt ingedeeld:
Superrijk
Eukaryota (organismen met celkern)
Rijk
Animalia (dieren)
Onderrijk
Metazoa (meercellige dieren)
Fylum
Arthropoda (geleedpotigen)
Subfylum
Tracheata (ademend via tracheën)
Superklasse
Hexapoda (zespotigen)
Klasse
Insecta (insecten)
Infraklasse
Neoptera (vleugels over achterlijf)
Orde
Hymenoptera (vliesvleugeligen)
Suborde
Apocrita (taille tussen 1e en 2e abdomensegment, propodeum)
Sectie
Aculaeta (angeldragers)
Superfamilie
Apoidea (bijen)
Familie
Apidae (bijen en hommels)
Subfamilie
Apinae
Tribus
Apini
Genus (geslacht)
Apis
Species (soort)
Mellifera
Subspecies (ondersoort)
A.m. carnica, A.m. intermissa etc...
Ondersoorten van de honingbij, Apis mellifera:
Europa
Midden Oosten
Afrika
A. m. iberica A. m. mellifera A. m. carnica A. m. cecropia A. m. ligustica A. m. macedonica A.m. ruttneri A. m. sicula
A. m. adamii A. m. anatolia A. m. syriaca A. m. caucasica A. m. cypria A. m. meda
A. m. adansonii A. m. capensis A. m. intermissa A. m. lamarckii A. m. litorea A. m. major A. m. monticola A. m. sahariensis A. m. scutellata A. m. unicolor